प्राचीन भारतीय ऋषि आध्यात्मिकता, चेतना और प्रकृति के वैज्ञानिक थे। मानव मन की गहनतम गहराई में उनकी कुशाग्रता ने उन्हें व्यवस्थित शोधन और आंतरिक विश्वास और मानव स्वयं की अंतर्निहित प्रवृत्तियों के विकास का एक आदर्श विज्ञान विकसित करने में सक्षम बनाया था। उन्होंने जनता के लाभ के लिए इस संबंध में षोडश संस्कारों - सोलह संस्कारों की परंपरा विकसित की थी। ये सोलह संस्कार आत्मसात कराने और प्रशिक्षण के तरीके हैं या जीवन के विशिष्ट संक्रमणकालीन चरणों के दौरान संचित वृत्तियों की शुद्धि और पुण्य प्रवृत्तियों के विकास के प्रयोग हैं। इनमें से प्रत्येक शक्तिशाली मंत्रों और यज्ञ की प्रक्रियाओं के संयोजन से जुड़े ऋषियों द्वारा किए गए दीर्घकालिक समर्पित शोध का परिणाम था। षोडश संस्कारों की यह प्रणाली मानव चेतना के सूक्ष्म स्तरों को प्रभावित करने के लिए तैयार की गई थी और इसलिए इसका प्रभाव मनो संस्थान, अंतःस्रावी तंत्र और आनुवंशिक तंत्र पर भी पड़ता था। षोडश संस्कार भारतीय संस्कृति और जीवन दर्शन का अभिन्न अंग हैं।
शांतिकुंज द्वारा सभी संस्कारों के वैज्ञानिक, मनोवैज्ञानिक और आध्यात्मिक प्रभावों की भी समीक्षा की गई। यहां प्रशिक्षण कार्यक्रमों के दौरान इन्हें पढ़ाया जाता है।
संस्कार प्रतिदिन सुबह 5.45 बजे शांतिकुंज में किए जाते हैं। किसी पूर्व निर्धारण की आवश्यकता नहीं है (विवाह संस्कार को छोड़कर) - बस एक दिन पहले सूचित कर दें। साझे में आवास और भोजन भी बिना किसी लागत के प्रदान किया जाता है।